郭靖 (@BGHong7G) 在 生信转录组数据下游分析——R实战交流探讨 中发帖
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自己结合各R包的参考文档写了一个转录组数据的R script,基于reads读段数据,进行DESeq2分析和GO、KEGG富集分析,最后进行差异基因与富集数据的作图。
接下来是针对不同分析数据的绘图演示:
火山图:
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PCA Plot
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Venn
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MDS
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Density Plot of Normalized Counts
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基于GO、KEGG分析数据图:
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GO富集分析,上调GO术语和下调GO术语:
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前25个差异基因表达箱型图:
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KEGG富集通路:
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数据Group为三组,数据来自自己课题组的下机数据,有兴趣的佬友可以一起交流探讨生信数据的下游分析