变色龙 (@bianselong) 在 我国科学家利用人工智能加速葡萄育种,效率提高 400% 中发帖
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要实现精准“设计”,一个基因组数据远远不够。在此基础上,周永锋团队又陆续对包括野生种和栽培品种在内的 9 个二倍体葡萄品种进行测序、组装,得到 18 个端粒到端粒的单倍型基因组,并整合已有的基因组数据,构建了目前首个最全面、最准确的葡萄泛基因组(Grapepan v1.0),总长度达 1.43Gb,是单个参考基因组大小的近 3 倍。
为了进一步弄清楚葡萄基因与性状之间的关联,周永锋团队从近万份葡萄品种中选取了 400 多份有代表性的葡萄品种,连续 3 年对包括果穗大小、浆果中代谢物含量、浆果大小和果皮颜色等在内的 29 个农艺性状进行调查,构建了葡萄基因型图谱和性状图谱。在此基础上,周永锋团队利用数量遗传学分析,鉴定到 148 个与农艺性状显著相关的位点,其中 122 个位点为首次发现。研究发现,调控不同性状的位点间存在关联性,如可溶性固形物含量和浆果宽度相关位点邻近...